Parmi ses principales activités, l’ARS veille notamment à la qualité des eaux de consommation et de baignade, à la qualité des prises en charge et à la bientraitance dans les établissements de santé et médico-sociaux. Elle protège la population des risques sanitaires (canicule, épidémie…) ou environnementaux (pollution…), 24 h sur 24 et 7 j/7. Elle définit, oriente et finance les principales actions de prévention et de promotion de la santé, en matière de nutrition, d’addictions, de santé mentale, etc.
L’ARS agit aussi au bénéfice des personnes âgées et handicapées, en mettant en œuvre les plans nationaux (Alzheimer, autisme…) en autorisant la création de structures d’accueil, de services et en les finançant. L’Agence met en œuvre tous les moyens dont elle dispose pour que la population ait accès dans les meilleures conditions à une prise en charge médicale en ville, à l’hôpital et dans une structure d’urgence. Elle organise et finance la permanence des soins, autorise l’implantation d’équipements lourds (scanners, IRM…), détermine les activités pratiquées dans les hôpitaux, etc. Elle soutient aussi ces établissements, financièrement et en matière d’ingénierie.
Par ailleurs, l’Agence pilote et finance le développement des maisons de santé pluriprofessionnelles, de la télémédecine, et met en œuvre les dispositifs favorisant l’installation de professionnels de santé dans la région.